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火山图绘制

火山图(Volcano Plot)在组学分析中常用的一种图,它能非常直观的显示表达差异的基因或蛋白。在火山图中显示了两个重要的指标(Fold change/p-Value),检验分析出两组样本间显著差异表达的基因后,以log2(fold change)为横坐标,以显著性检验(常用的为T test) P值的负对数-log10(P-value)为纵坐标,利用一定的筛选条件(如大于1.5倍变化且P<0.05),可以筛选出显著差异表达的基因,进行后续研究。我们采用R的ggplot2包可以定制化的生成火山图。