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  SAP4B-细菌序列自动化注释平台

 (近期将推出,目前在调试中...) 

SAP4P(Sequence annotation pipeline for bacterium)是一款用于细菌DNA序列自动化注释的软件,可完成对细菌基因组序列、框架图序列和片段序列进行批量的基因预测、功能注释、COG分类、Gene Ontology分析、KEGG Pathway分析和图形化显示等一系列的分析,提供Reads和Contig统计分析、Contig基于参考序列排列和图形化显示。

主要功能:
1.         自动化的对文件中的每个大于500bp的序列进行编码框预测、注释和功能分类;
2.         Contig和ORF统计;
3.         COG功能分类;
4.         KEGG Pathway分析;
5.         tRNA, rRNA搜索;
6.         Contig基于参照基因组的排列。
部分结果展示:

 

 

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